跳到主要内容

hpc高性能集群

用户手册

用户管理

采用 nis 作为集群平台统一的用户管理.

调度系统

采用 slurm 调度, 预配置作业调度脚本.

集群管理

采用 xcat 管理集群, 包括批命令, 批拷贝, 远程开关机等. 通过 environment-modules 管理环境变量.

终端登录

ssh 终端登录管理登录节点, 入口ip: 172.16.8.200, 端口号: 2277
vim job.slurm 编辑修改作业脚本
sbatch job.slurm 提交作业

启动 gui 程序

下载安装 MobaXterm 软件, 登录后, 直接运行 gui 程序即可.

作业提交

普通作业
mpi 作业
交互式作业


cat job.slurm

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=test
#SBATCH --output=test_%j.out
#SBATCH --error=test_%j.err
#SBATCH --partition compute
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --tasks-per-node=2
#SBATCH --cpus-per-task=1
python job.py

sbatch job.slurm


cat vasp.slurm

#!/bin/bash
#SBATCH -o job.%j.out
#SBATCH --partition=compute
#SBATCH -J myFirstMPIJob
#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks-per-node=32

# 导入MPI运行环境
module load intel/2017.1

# 导入MPI应用程序
module load vasp/5.4.4-intel-2017.1

# 生成 machinefile
srun hostname -s | sort -n >slurm.hosts

# 执行MPI并行计算程序
mpirun -n 64 -machinefile slurm.hosts vasp_std > log

sbatch vasp.slurm

srun --time=1:00:00 --nodes=1 --ntasks=32 --partition=gpu --pty bash

💡提示 tip

禁止使用 yum update 或 yum upgrade 升级系统, 如果有重要安装漏洞, 确实需要升级, 请联系售后
尽量不要使用 root 超级用户, 除非是添加用户，维护系统等必须要使用 root 权限的操作. 具备一定的 linux 系统管理经验的用户才可以使用 root 进行维护工作.

🔥注意 Caution

请不要直接在管理登录节点进行任务操作!!!
请不要直接在管理登录节点进行 TB 级别数据拷贝!!!